Οι αλλαγές διοικήσεων  ξεκίνησαν με σαρωτικό τρόπο και  δεν συνδέονται μόνον με τη διαδικασία αξιοποίησης και την αλλαγή κυβέρνησης, αλλά και με τη διαπίστωση από την αρμόδια διεύθυνση του ΤΑΙΠΕΔ  πως σε ορισμένα λιμάνια υπήρξαν καταγγελίες για κακοδιαχείριση.

Μάλιστα, σε κάποια από αυτά, όπως του Βόλου, διενεργείται ήδη διαχειριστικός έλεγχος επί των πεπραγμένων των διοικήσεων που τοποθετήθηκαν από το 2015 και μετά. 

Στον Βόλο πρόεδρος τοποθετήθηκε η  Βιολέττα Μήτρου και διευθύνων σύμβουλος ο Σωκράτης Αναγνώστου.

Στην Ηγουμενίτσα η Ρεγγίνα Δηλαβέρη και ο Αθανάσιος Πορφύρης τοποθετήθηκαν ως πρόεδρος και διευθύνων αντίστοιχα. 

Στην Κέρκυρα, πρόεδρος ο Γεώργιος Χονδρογιάννης και διευθύνων ο Σπύρος Ζερβόπουλος.

Στην Καβάλα ο Γεώργιος Φιλοσόφου και η Αννα Θυσιάδου. 

Έπονται κι άλλες αντικαταστάσεις ενώ έχουν απομακρυνθεί και τοποθετηθεί και πολλά μέλη των διοικητικών συμβουλίων.